皮膚疾患では、主に脱毛症状や痒がる様子が見られ、皮膚が赤くただれた状態になることもあります。ノミやマダニなどの寄生やアレルギー反応の他にも、細菌感染による外耳炎や膿皮症、毛包炎などが考えられ、必要に応じて皮膚検査やアレルギー検査などを行った上で治療を行います。
また、柴犬やフレンチブルドックなどの犬種はアトピー性皮膚炎を起こしやすく、そのような場合にはシャンプーや食事管理などの日々のケアが必要になります。

胃腸炎では、嘔吐や下痢、腹痛などの症状が見られます。急性の胃腸炎の場合、一日に何度も吐いたり下痢をしたりします。ストレスや楽しい出来事（旅行など）が原因の場合は数日で改善することもありますが、誤飲誤食が原因であったり膵炎などが併発している場合は、治療しないまま放置すると命に関わる可能性があります。慢性の胃腸炎の場合は治療後も再発を繰り返す可能性があるため、治療に加えて日常的な食事などの指導も行います。
また嘔吐や下痢、食欲不振は腫瘍などに関連して見られることもあるため、詳しい検査が必要になる場合もございます。

高齢の犬では心臓の弁の異常により血液の逆流を生じる僧帽弁閉鎖不全症がよく見られます。これにより血液を全身に送ることが困難になり心臓の負担がどんどん増えることになります。最終的には肺に水が溜まる肺水腫を引き起こす危険性が高くなる命に関わる病気です。聴診で心雑音を発見し、心臓超音波検査を行うことにより早期診断することができます。
この病気が診断された場合には定期的に心臓検査を行い、適切な治療を選択することで進行を遅らせることが必要です。

身体にしこりがあり腫瘍が疑われる場合や、健康診断で悪性腫瘍（がん）を発見した場合、基本的には手術で腫瘍を取り除くか、抗がん剤の投与によって治療します。獣医腫瘍科認定医II種の資格を有する獣医師が、必要な検査を実施した上で適切な手術・治療を行うことができるよう努めます。飼い主様が自宅でしこりを発見された場合には、早めにご相談ください。

ミニチュアダックスフンドやトイプードル、チワワなどの小型犬は、胸腰部椎間板ヘルニアや頚椎椎間板ヘルニアなどを発症しやすい傾向にあります。特に頚椎椎間板ヘルニアの手術は胸腰部の椎間板ヘルニアよりも難易度が高く、新潟県内で対応可能な動物病院が少ない状況にありますが、あたご犬猫病院では神経外科手術を長年行ってきた獣医師が手術を行うことができます。